Ключевые слова: геометрия аминокислот, геометрия белков, третичная структура
Аннотация
В работе описан ряд геометрико-статистических методов, которые позволяют анализировать информацию, содержащуюся в Protein Data Bank и других подобных базах даных, на на внутреннюю непротиворечивость и согласованность с общей теорией. Также демонстрируется ряд примеров, показывающих, что данные PDB требуют тщательного отбора и анализа.
Keywords: amino-acids geometry, protein geometry, spacial structure
Abstract
In the paper we present several geometrical and statistical methods analysing information contained in Protein Data Bank and similar data bases for consistency and general theory fitting. Also we include a list of examples demonstrating the necessity of careful analysis and sampling of the PDB items.
[ Full text ]